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WWPNゾーニングとも言う。WWPN単位で行うゾーニング。機器を交換した場合に再設定が必要。(WWPNが変更となるため)ただし機器の接続ポートを移動した場合は再ゾーニングは不要。本番環境では機器の接続ポートが変更になる場合は少ないので、この方式は採用されずポートゾーニングが採用される場合が多い。
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