選択したファイルの種類は複数のシートを含むブックをサポートしていません。
選択しているシートのみを保存する場合は [OK] をクリックしてください。
すべてのシートを保存する場合は、それぞれのシートに別の名前を付けて保存するか、または複数のシートをサポートするファイルの種類を選択してください。
この警告の原因
とても重要な警告なので注意してください。
これは複数シートが存在するExcel ファイルでCSV形式で保存した場合に発生します。
CSV形式は複数シートをサポートしていません。よってExcel で複数シートが存在するファイルでCSV形式で保存すると、すべてのシートの情報が保存されません。データがロストすることになります。よって複数シートが存在する場合は絶対にCSV形式で保存しないでください。CSV形式で一度保存すると、元のExcel の状態には戻せません。
参考：
Excel 形式保存 と CSV 形式保存の違いを比較表で説明
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